메뉴 건너뛰기

Bigdata, Semantic IoT, Hadoop, NoSQL

Bigdata, Hadoop ecosystem, Semantic IoT등의 프로젝트를 진행중에 습득한 내용을 정리하는 곳입니다.
필요한 분을 위해서 공개하고 있습니다. 문의사항은 gooper@gooper.com로 메일을 보내주세요.


* sprue는 Apache Spark와 Drools를 이용한 CEP구현한 예제 소스이다.

(참고 : https://github.com/mganta/sprue)


<<준비/설정>>

1. hbase에 테이블 생성

create 'patientData', {NAME => 'cf1', VERSIONS => 3, REPLICATION_SCOPE => 1, COMPRESSION => 'SNAPPY'}

==> hbase 버전에 따라서 아래의 오류가 발생할 수 있는데 그때는  COMPRESSION => 'SNAPPY'부분을 빼고 실행한다.


* 다음의 사이트에서 로직을 테스트 할 수 있다.

   : http://www.mdcalc.com/sirs-sepsis-and-septic-shock-criteria/


2. drools가 사용하는 의사결정테이블 파일은 src/main/resources/sepsis.xls를 사용한다.


3. driver program은 3개의 인자를 받는다.


    a. zookeeper info

    b. rules xls file

    c. open tsdb url

   

    - opentsdb이 설치되지 않았으면 SepsisStream.scala파일의 94(97 ?)라인을 주석처리한다.

    - HBase가 설정되지 않았다면 69 & 80(73 & 84 ?) 라인을 주석처리한다.

    - local mode로 실행할 경우는 SepsisStream.scala파일의 40 & 41의 주석을 바꾼다.


4. 이 프로그램은 queueRDD를 이용하여 sample data를 생성한다.



<<컴파일/실행하기>>


1. mvn clean package


//2. Create the hbase table. Sample script in src/main/resource/create_hbase_table.rb


//3. Install opentsdb (http://opentsdb.net/docs/build/html/installation.html)


4. Start spark streaming using


   spark-submit --driver-java-options 

       '-Dspark.executor.extraClassPath=/opt/cloudera/parcels/CDH/lib/hbase/lib/htrace-core-3.1.0-incubating.jar' 

--master yarn-client 

--files sepsis.xls 

--class com.cloudera.sprue.SepsisStream 

/path_to/sprue-0.0.1-SNAPSHOT-jar-with-dependencies.jar 

sepsis.xls zookeeper.host.domain:2181 

http://opentsdb.host.domain:4242/api/put


 * spark.executor.extraClassPath옵션은 spark에서 실행되는 hbase의 설치위치의 lib에 있는 htrace-core-3.1.0-incubating.jar를 지정한다.


 * files옵션은 spark executor들이 사용하는 xls파일을 업로드 한다.


-------------------오류내용------------------------

ERROR: org.apache.hadoop.hbase.DoNotRetryIOException: Compression algorithm 'snappy' previously failed test. Set hbase.table.sanity.checks to false at conf or table descriptor if you want to bypass sanity checks

        at org.apache.hadoop.hbase.master.HMaster.warnOrThrowExceptionForFailure(HMaster.java:1603)

        at org.apache.hadoop.hbase.master.HMaster.sanityCheckTableDescriptor(HMaster.java:1542)

        at org.apache.hadoop.hbase.master.HMaster.createTable(HMaster.java:1452)

        at org.apache.hadoop.hbase.master.MasterRpcServices.createTable(MasterRpcServices.java:429)

        at org.apache.hadoop.hbase.protobuf.generated.MasterProtos$MasterService$2.callBlockingMethod(MasterProtos.java:52195)

        at org.apache.hadoop.hbase.ipc.RpcServer.call(RpcServer.java:2117)

        at org.apache.hadoop.hbase.ipc.CallRunner.run(CallRunner.java:104)

        at org.apache.hadoop.hbase.ipc.RpcExecutor.consumerLoop(RpcExecutor.java:133)

        at org.apache.hadoop.hbase.ipc.RpcExecutor$1.run(RpcExecutor.java:108)

        at java.lang.Thread.run(Thread.java:745)

Caused by: org.apache.hadoop.hbase.DoNotRetryIOException: Compression algorithm 'snappy' previously failed test.

        at org.apache.hadoop.hbase.util.CompressionTest.testCompression(CompressionTest.java:91)

        at org.apache.hadoop.hbase.master.HMaster.checkCompression(HMaster.java:1686)

        at org.apache.hadoop.hbase.master.HMaster.checkCompression(HMaster.java:1679)

        at org.apache.hadoop.hbase.master.HMaster.sanityCheckTableDescriptor(HMaster.java:1540)

        ... 8 more

번호 제목 글쓴이 날짜 조회 수
50 hive기동시 Caused by: java.net.URISyntaxException: Relative path in absolute URI: ${system:java.io.tmpdir%7D/$%7Bsystem:user.name%7D 오류 발생시 조치사항 총관리자 2016.09.25 496
49 spark-submit 실행시 "java.lang.OutOfMemoryError: Java heap space"발생시 조치사항 총관리자 2018.02.01 517
48 [Kudu]ERROR: Unable to advance iterator for node with id '2' for Kudu table 'impala::core.pm0_abdasubjct': Network error: recv error from unknown peer: Transport endpoint is not connected (error 107) gooper 2023.03.16 536
47 spark client프로그램 기동시 "Error initializing SparkContext"오류 발생할때 조치사항 총관리자 2016.05.27 539
46 CentOS 7.x에 Jupyter설치 총관리자 2018.04.18 550
45 spark-shell실행시 "A read-only user or a user in a read-only database is not permitted to disable read-only mode on a connection."오류가 발생하는 경우 해결방법 총관리자 2016.05.20 551
44 spark-env.sh에서 사용할 수있는 항목. 총관리자 2016.05.24 568
43 kafka로 부터 메세지를 stream으로 받아 처리하는 spark샘플소스(spark의 producer와 consumer를 sbt로 컴파일 하고 서버에서 spark-submit하는 방법) 총관리자 2016.07.13 630
42 hive테이블의 물리적인 위치인 HDFS에 여러개의 데이터 파일이 존재할때 한개의 파일로 merge하여 동일한 테이블에 입력하는 방법 총관리자 2019.05.23 640
41 lateral view 예제 총관리자 2014.09.18 691
40 [Impala 3.2버젼]compute incremental stats db명.테이블명 수행시 ERROR: AnalysisException: Incremental stats size estimate exceeds 2000.00MB. 오류 발생원인및 조치방안 gooper 2022.11.30 697
39 hive metastore ERD file 총관리자 2018.09.20 731
38 beeline실행시 User: root is not allowed to impersonate오류 발생시 조치사항 총관리자 2016.06.03 760
37 oracle to hive data type정리표 총관리자 2018.08.22 764
36 hive query에서 mapreduce돌리지 않고 select하는 방법 총관리자 2014.05.23 811
35 dual table만들기 총관리자 2014.05.16 826
34 Hive JDBC Connection과 유형별 에러및 필요한 jar파일 총관리자 2021.05.24 836
33 unique한 값 생성 총관리자 2014.04.25 888
32 json으로 존재하는 데이터 parsing하기 총관리자 2019.03.25 974
31 hive에서 insert overwrite directory.. 로 하면 default column구분자는 'SOH'혹은 't'가 됨 총관리자 2014.05.20 999

A personal place to organize information learned during the development of such Hadoop, Hive, Hbase, Semantic IoT, etc.
We are open to the required minutes. Please send inquiries to gooper@gooper.com.

위로