메뉴 건너뛰기

Bigdata, Semantic IoT, Hadoop, NoSQL

Bigdata, Hadoop ecosystem, Semantic IoT등의 프로젝트를 진행중에 습득한 내용을 정리하는 곳입니다.
필요한 분을 위해서 공개하고 있습니다. 문의사항은 gooper@gooper.com로 메일을 보내주세요.


* sprue는 Apache Spark와 Drools를 이용한 CEP구현한 예제 소스이다.

(참고 : https://github.com/mganta/sprue)


<<준비/설정>>

1. hbase에 테이블 생성

create 'patientData', {NAME => 'cf1', VERSIONS => 3, REPLICATION_SCOPE => 1, COMPRESSION => 'SNAPPY'}

==> hbase 버전에 따라서 아래의 오류가 발생할 수 있는데 그때는  COMPRESSION => 'SNAPPY'부분을 빼고 실행한다.


* 다음의 사이트에서 로직을 테스트 할 수 있다.

   : http://www.mdcalc.com/sirs-sepsis-and-septic-shock-criteria/


2. drools가 사용하는 의사결정테이블 파일은 src/main/resources/sepsis.xls를 사용한다.


3. driver program은 3개의 인자를 받는다.


    a. zookeeper info

    b. rules xls file

    c. open tsdb url

   

    - opentsdb이 설치되지 않았으면 SepsisStream.scala파일의 94(97 ?)라인을 주석처리한다.

    - HBase가 설정되지 않았다면 69 & 80(73 & 84 ?) 라인을 주석처리한다.

    - local mode로 실행할 경우는 SepsisStream.scala파일의 40 & 41의 주석을 바꾼다.


4. 이 프로그램은 queueRDD를 이용하여 sample data를 생성한다.



<<컴파일/실행하기>>


1. mvn clean package


//2. Create the hbase table. Sample script in src/main/resource/create_hbase_table.rb


//3. Install opentsdb (http://opentsdb.net/docs/build/html/installation.html)


4. Start spark streaming using


   spark-submit --driver-java-options 

       '-Dspark.executor.extraClassPath=/opt/cloudera/parcels/CDH/lib/hbase/lib/htrace-core-3.1.0-incubating.jar' 

--master yarn-client 

--files sepsis.xls 

--class com.cloudera.sprue.SepsisStream 

/path_to/sprue-0.0.1-SNAPSHOT-jar-with-dependencies.jar 

sepsis.xls zookeeper.host.domain:2181 

http://opentsdb.host.domain:4242/api/put


 * spark.executor.extraClassPath옵션은 spark에서 실행되는 hbase의 설치위치의 lib에 있는 htrace-core-3.1.0-incubating.jar를 지정한다.


 * files옵션은 spark executor들이 사용하는 xls파일을 업로드 한다.


-------------------오류내용------------------------

ERROR: org.apache.hadoop.hbase.DoNotRetryIOException: Compression algorithm 'snappy' previously failed test. Set hbase.table.sanity.checks to false at conf or table descriptor if you want to bypass sanity checks

        at org.apache.hadoop.hbase.master.HMaster.warnOrThrowExceptionForFailure(HMaster.java:1603)

        at org.apache.hadoop.hbase.master.HMaster.sanityCheckTableDescriptor(HMaster.java:1542)

        at org.apache.hadoop.hbase.master.HMaster.createTable(HMaster.java:1452)

        at org.apache.hadoop.hbase.master.MasterRpcServices.createTable(MasterRpcServices.java:429)

        at org.apache.hadoop.hbase.protobuf.generated.MasterProtos$MasterService$2.callBlockingMethod(MasterProtos.java:52195)

        at org.apache.hadoop.hbase.ipc.RpcServer.call(RpcServer.java:2117)

        at org.apache.hadoop.hbase.ipc.CallRunner.run(CallRunner.java:104)

        at org.apache.hadoop.hbase.ipc.RpcExecutor.consumerLoop(RpcExecutor.java:133)

        at org.apache.hadoop.hbase.ipc.RpcExecutor$1.run(RpcExecutor.java:108)

        at java.lang.Thread.run(Thread.java:745)

Caused by: org.apache.hadoop.hbase.DoNotRetryIOException: Compression algorithm 'snappy' previously failed test.

        at org.apache.hadoop.hbase.util.CompressionTest.testCompression(CompressionTest.java:91)

        at org.apache.hadoop.hbase.master.HMaster.checkCompression(HMaster.java:1686)

        at org.apache.hadoop.hbase.master.HMaster.checkCompression(HMaster.java:1679)

        at org.apache.hadoop.hbase.master.HMaster.sanityCheckTableDescriptor(HMaster.java:1540)

        ... 8 more

번호 제목 글쓴이 날짜 조회 수
50 파일끝에 붙는 ^M 일괄 지우기(linux, unix(AIX)) 혹은 파일내에 있는 ^M지우기 총관리자 2016.09.24 78
49 start-all.sh로 spark데몬 기동시 "JAVA_HOME is not set"오류 발생시 조치사항 총관리자 2016.08.01 126
» Apache Spark와 Drools를 이용한 CEP구현 테스트 총관리자 2016.07.15 342
47 kafka로 부터 메세지를 stream으로 받아 처리하는 spark샘플소스(spark의 producer와 consumer를 sbt로 컴파일 하고 서버에서 spark-submit하는 방법) 총관리자 2016.07.13 630
46 spark-sql실행시 ERROR log: Got exception: java.lang.NumberFormatException For input string: "2000ms" 오류발생시 조치사항 총관리자 2016.06.09 167
45 spark-sql실행시 Caused by: java.lang.NumberFormatException: For input string: "0s" 오류발생시 조치사항 총관리자 2016.06.09 2802
44 spark-sql실행시 The specified datastore driver ("com.mysql.jdbc.Driver") was not found in the CLASSPATH오류 발생시 조치사항 총관리자 2016.06.09 442
43 ./spark-sql 실행시 "java.lang.NumberFormatException: For input string: "1s"오류발생시 조치사항 총관리자 2016.06.09 132
42 beeline실행시 User: root is not allowed to impersonate오류 발생시 조치사항 총관리자 2016.06.03 759
41 Caused by: java.net.URISyntaxException: Relative path in absolute URI: ${system:java.io.tmpdir%7D/$%7Bsystem:user.name%7D오류발생시 조치사항 총관리자 2016.06.03 1141
40 impala 설치/설정 총관리자 2016.06.03 1029
39 hive 2.0.1 설치및 mariadb로 metastore 설정 총관리자 2016.06.03 5184
38 Scala버젼 변경 혹은 상황에 맞게 Spark소스 컴파일하기 총관리자 2016.05.31 67
37 spark client프로그램 기동시 "Error initializing SparkContext"오류 발생할때 조치사항 총관리자 2016.05.27 539
36 spark-submit으로 spark application실행하는 다양한 방법 총관리자 2016.05.25 303
35 spark 온라인 책자링크 (제목 : mastering-apache-spark) 총관리자 2016.05.25 48
34 "Initial job has not accepted any resources; check your cluster UI to ensure that workers are registered and have sufficient resources"오류 발생시 조치사항 총관리자 2016.05.25 1027
33 spark-env.sh에서 사용할 수있는 항목. 총관리자 2016.05.24 567
32 Spark 1.6.1 설치후 HA구성 총관리자 2016.05.24 455
31 spark-shell실행시 "A read-only user or a user in a read-only database is not permitted to disable read-only mode on a connection."오류가 발생하는 경우 해결방법 총관리자 2016.05.20 551

A personal place to organize information learned during the development of such Hadoop, Hive, Hbase, Semantic IoT, etc.
We are open to the required minutes. Please send inquiries to gooper@gooper.com.

위로