메뉴 건너뛰기

검색창 닫기

Bigdata, Semantic IoT, Hadoop, NoSQL

Bigdata, Hadoop ecosystem, Semantic IoT등의 프로젝트를 진행중에 습득한 내용을 정리하는 곳입니다.
필요한 분을 위해서 공개하고 있습니다. 문의사항은 gooper@gooper.com로 메일을 보내주세요.


Hadoop 갑자기 DataNode가 java.io.IOException: Premature EOF from inputStream를 반복적으로 발생시키다가 java.lang.OutOfMemoryError: Java heap space를 내면서 죽는 경우 조치방법

총관리자 2017.07.19 10:47 조회 수 : 1673

Hadoop의 각 데몬을 기동하여 정상 작동중이다가 갑자기 DataNode가 아래와 같은 오류를 내면서 죽는 경우가 있다.

원인은 Heap메모리가 부족하여 발생하는 문제이다. 이때는 아래 내용을 참조하여 HEAP사이즈를 변경하여 각서버에 반영하고 Hadoop전체를 다시

재 기동시켜서 반영해준다.

(분제가 발생하는 노드는 전체 클러스트와 메모리는 같은데 HardDisk용량이 2.5배 정도 되는데 다른 노드에 비해서 데이타 유입량이 더 많아서

동한 다른 노드와 같은 설정을 하면 이용하면서 HEAP메모리 부족현상이 발생되는것으로 보임)


1. hadoop-env.sh에서
export HADOOP_HEAPSIZE을
export HADOOP_HEAPSIZE=3000 으로 설정한다.

export HADOOP_NAMENODE_INIT_HEAPSIZE=""을
export HADOOP_NAMENODE_INIT_HEAPSIZE="2000" 으로 설정한다.


2. mapred-env.sh에서
export HADOOP_JOB_HISTORYSERVER_HEAPSIZE=1000을
export HADOOP_JOB_HISTORYSERVER_HEAPSIZE=2000 으로 설정한다.


3. yarn-env.sh에서

JAVA_HEAP_MAX=-Xmx1000m 를
JAVA_HEAP_MAX=-Xmx2000m 으로 설정한다.

# YARN_HEAPSIZE=1000을
YARN_HEAPSIZE=2000 으로 설정한다.




-----------------------------------오류내용--------------------------------
2017-07-18 20:20:38,668 INFO org.apache.hadoop.util.JvmPauseMonitor: Detected pause in JVM or host machine (eg GC): pause of approximately 1265ms
GC pool 'PS MarkSweep' had collection(s): count=2 time=1764ms
2017-07-18 20:20:32,678 INFO org.apache.hadoop.hdfs.server.datanode.DataNode: opWriteBlock BP-605282214-XXX.XXX.XXX.XXX-1498555165989:blk_1076520983_2780234 received exception java.io.IOException: Premature EOF from inputStream
2017-07-18 20:20:30,934 INFO org.apache.hadoop.hdfs.server.datanode.DataNode: PacketResponder: BP-605282214-XXX.XXX.XXX.XXX-1498555165989:blk_1076520963_2780213, type=LAST_IN_PIPELINE, downstreams=0:[] terminating
2017-07-18 20:20:47,191 INFO org.apache.hadoop.hdfs.server.datanode.DataNode: opWriteBlock BP-605282214-XXX.XXX.XXX.XXX-1498555165989:blk_1076520963_2780213 received exception java.io.IOException: Premature EOF from inputStream
2017-07-18 20:20:47,191 INFO org.apache.hadoop.hdfs.server.datanode.DataNode: Block pool BP-605282214-XXX.XXX.XXX.XXX-1498555165989 (Datanode Uuid d4f1b1f7-0636-483d-91e8-4780b73fb392) service to sda1/XXX.XXX.XXX.XXX:9000 beginning handsh
ake with NN
2017-07-18 20:20:48,073 ERROR org.apache.hadoop.hdfs.server.datanode.DataNode: sda2:50010:DataXceiver error processing WRITE_BLOCK operation  src: /XXX.XXX.XXX.XXX:43840 dst: /XXX.XXX.XXX.XXX:50010
java.io.IOException: Premature EOF from inputStream
        at org.apache.hadoop.io.IOUtils.readFully(IOUtils.java:201)
        at org.apache.hadoop.hdfs.protocol.datatransfer.PacketReceiver.doReadFully(PacketReceiver.java:213)
        at org.apache.hadoop.hdfs.protocol.datatransfer.PacketReceiver.doRead(PacketReceiver.java:134)
        at org.apache.hadoop.hdfs.protocol.datatransfer.PacketReceiver.receiveNextPacket(PacketReceiver.java:109)
        at org.apache.hadoop.hdfs.server.datanode.BlockReceiver.receivePacket(BlockReceiver.java:501)
        at org.apache.hadoop.hdfs.server.datanode.BlockReceiver.receiveBlock(BlockReceiver.java:895)
        at org.apache.hadoop.hdfs.server.datanode.DataXceiver.writeBlock(DataXceiver.java:801)
        at org.apache.hadoop.hdfs.protocol.datatransfer.Receiver.opWriteBlock(Receiver.java:137)
        at org.apache.hadoop.hdfs.protocol.datatransfer.Receiver.processOp(Receiver.java:74)
        at org.apache.hadoop.hdfs.server.datanode.DataXceiver.run(DataXceiver.java:253)
        at java.lang.Thread.run(Thread.java:745)
2017-07-18 20:20:48,073 ERROR org.apache.hadoop.hdfs.server.datanode.DataNode: sda2:50010:DataXceiver error processing WRITE_BLOCK operation  src: /166.104.112.69:45343 dst: /XXX.XXX.XXX.XXX:50010
java.io.IOException: Premature EOF from inputStream
        at org.apache.hadoop.io.IOUtils.readFully(IOUtils.java:201)
        at org.apache.hadoop.hdfs.protocol.datatransfer.PacketReceiver.doReadFully(PacketReceiver.java:213)
        at org.apache.hadoop.hdfs.protocol.datatransfer.PacketReceiver.doRead(PacketReceiver.java:134)
        at org.apache.hadoop.hdfs.protocol.datatransfer.PacketReceiver.receiveNextPacket(PacketReceiver.java:109)
        at org.apache.hadoop.hdfs.server.datanode.BlockReceiver.receivePacket(BlockReceiver.java:501)
        at org.apache.hadoop.hdfs.server.datanode.BlockReceiver.receiveBlock(BlockReceiver.java:895)
        at org.apache.hadoop.hdfs.server.datanode.DataXceiver.writeBlock(DataXceiver.java:801)
        at org.apache.hadoop.hdfs.protocol.datatransfer.Receiver.opWriteBlock(Receiver.java:137)
        at org.apache.hadoop.hdfs.protocol.datatransfer.Receiver.processOp(Receiver.java:74)
        at org.apache.hadoop.hdfs.server.datanode.DataXceiver.run(DataXceiver.java:253)
        at java.lang.Thread.run(Thread.java:745)
2017-07-18 20:20:57,083 INFO org.apache.hadoop.hdfs.server.datanode.DataNode: Block pool Block pool BP-605282214-XXX.XXX.XXX.XXX-1498555165989 (Datanode Uuid d4f1b1f7-0636-483d-91e8-4780b73fb392) service to sda1/XXX.XXX.XXX.XXX:9000 succe
ssfully registered with NN
2017-07-18 20:21:00,044 INFO org.apache.hadoop.util.JvmPauseMonitor: Detected pause in JVM or host machine (eg GC): pause of approximately 1178ms
GC pool 'PS MarkSweep' had collection(s): count=2 time=1677ms
2017-07-18 20:21:05,452 INFO org.apache.hadoop.util.JvmPauseMonitor: Detected pause in JVM or host machine (eg GC): pause of approximately 2133ms
GC pool 'PS MarkSweep' had collection(s): count=3 time=2632ms
2017-07-18 20:21:12,342 INFO org.apache.hadoop.util.JvmPauseMonitor: Detected pause in JVM or host machine (eg GC): pause of approximately 1229ms
GC pool 'PS MarkSweep' had collection(s): count=2 time=1729ms
2017-07-18 20:21:14,056 INFO org.apache.hadoop.util.JvmPauseMonitor: Detected pause in JVM or host machine (eg GC): pause of approximately 1214ms
GC pool 'PS MarkSweep' had collection(s): count=2 time=1713ms
2017-07-18 20:21:28,386 WARN org.apache.hadoop.hdfs.server.datanode.DataNode: Unexpected exception in block pool Block pool BP-605282214-XXX.XXX.XXX.XXX-1498555165989 (Datanode Uuid d4f1b1f7-0636-483d-91e8-4780b73fb392) service to sda1/1
66.104.112.43:9000
java.lang.OutOfMemoryError: Java heap space
2017-07-18 20:21:28,386 WARN org.apache.hadoop.hdfs.server.datanode.DataNode: Ending block pool service for: Block pool BP-605282214-XXX.XXX.XXX.XXX-1498555165989 (Datanode Uuid d4f1b1f7-0636-483d-91e8-4780b73fb392) service to sda1/166.1
04.112.43:9000
2017-07-18 20:21:29,958 INFO org.apache.hadoop.util.JvmPauseMonitor: Detected pause in JVM or host machine (eg GC): pause of approximately 1205ms
GC pool 'PS MarkSweep' had collection(s): count=2 time=1704ms
2017-07-18 20:21:40,231 INFO org.apache.hadoop.util.JvmPauseMonitor: Detected pause in JVM or host machine (eg GC): pause of approximately 1431ms
GC pool 'PS MarkSweep' had collection(s): count=2 time=1931ms
2017-07-18 20:21:45,597 INFO org.apache.hadoop.util.JvmPauseMonitor: Detected pause in JVM or host machine (eg GC): pause of approximately 3310ms
GC pool 'PS MarkSweep' had collection(s): count=4 time=3808ms
2017-07-18 20:21:55,800 INFO org.apache.hadoop.hdfs.server.datanode.DataNode: Removed Block pool BP-605282214-XXX.XXX.XXX.XXX-1498555165989 (Datanode Uuid d4f1b1f7-0636-483d-91e8-4780b73fb392)
2017-07-18 20:21:58,707 INFO org.apache.hadoop.util.JvmPauseMonitor: Detected pause in JVM or host machine (eg GC): pause of approximately 5945ms
GC pool 'PS MarkSweep' had collection(s): count=12 time=13105ms
2017-07-18 20:22:00,356 INFO org.apache.hadoop.hdfs.server.datanode.fsdataset.impl.FsDatasetImpl: Removing block pool BP-605282214-XXX.XXX.XXX.XXX-1498555165989
2017-07-18 20:22:03,000 WARN org.apache.hadoop.hdfs.server.datanode.DataNode: Exiting Datanode
2017-07-18 20:22:03,001 INFO org.apache.hadoop.util.ExitUtil: Exiting with status 0
2017-07-18 20:22:03,002 INFO org.apache.hadoop.util.JvmPauseMonitor: Detected pause in JVM or host machine (eg GC): pause of approximately 1085ms
GC pool 'PS MarkSweep' had collection(s): count=1 time=1233ms
2017-07-18 20:22:03,003 INFO org.apache.hadoop.hdfs.server.datanode.DataNode: SHUTDOWN_MSG:
/************************************************************
SHUTDOWN_MSG: Shutting down DataNode at sda2/XXX.XXX.XXX.XXX
************************************************************/

이 게시물을
목록
번호 제목 글쓴이 날짜 조회 수
27 Container killed by the ApplicationMaster. Container killed on request. Exit code is 143 Container exited with a non-zero exit code 143 TaskAttempt killed because it ran on unusable node 오류시 조치방법 총관리자 2017.04.06 324
26 Ubuntu 16.04 LTS에 4대에 Hadoop 2.8.0설치 총관리자 2017.05.01 520
25 Cleaning up the staging area file시 'cannot access' 혹은 'Directory is not writable' 발생시 조치사항 총관리자 2017.05.02 333
24 hadoop에서 yarn jar ..를 이용하여 appliction을 실행하여 정상적으로 수행되었으나 yarn UI의 어플리케이션 목록에 나타나지 않는 문제 총관리자 2017.05.02 24
23 hadoop에서 yarn jar ..를 이용하여 appliction을 실행하여 정상적으로 수행되었으나 yarn UI의 어플리케이션 목록에 나타나지 않는 문제 총관리자 2017.05.02 51
22 hadoop에서 yarn jar ..를 이용하여 appliction을 실행하여 정상적으로 수행되었으나 yarn UI의 어플리케이션 목록에 나타나지 않는 문제 총관리자 2017.05.02 117
21 hadoop에서 yarn jar ..를 이용하여 appliction을 실행하여 정상적(?)으로 수행되었으나 yarn UI의 어플리케이션 목록에 나타나지 않는 문제 총관리자 2017.05.02 77
20 mapreduce appliction을 실행시 "is running beyond virtual memory limits" 오류 발생시 조치사항 총관리자 2017.05.04 16895
» 갑자기 DataNode가 java.io.IOException: Premature EOF from inputStream를 반복적으로 발생시키다가 java.lang.OutOfMemoryError: Java heap space를 내면서 죽는 경우 조치방법 총관리자 2017.07.19 1673
18 Windows7 64bit 환경에서 Apache Hadoop 2.7.1설치하기 총관리자 2017.07.26 235
17 hadoop cluster구성된 노드를 확인시 Capacity를 보면 색이 붉은색으로 표시되어 있는 경우나 Unhealthy인 경우 처리방법 총관리자 2017.08.30 46
16 editLog의 문제로 발생하는 journalnode 기동 오류 발생시 조치사항 총관리자 2017.09.14 313
15 Hadoop 2.7.x에서 사용할 수 있는 파일/디렉토리 관련 util성 클래스 파일 총관리자 2017.09.28 70
14 hadoop cluster에 포함된 노드중에서 문제있는 decommission하는 방법및 절차 file 총관리자 2017.12.28 660
13 [2.7.2] distribute-exclude.sh사용할때 ssh 포트변경에 따른 오류발생시 조치사항 총관리자 2018.01.02 89
12 [Decommission]시 시간이 많이 걸리면서(수일) Decommission이 완료되지 않는 경우 조치 총관리자 2018.01.03 5257
11 HA(Namenode, ResourceManager, Kerberos) 및 보안(Zookeeper, Hadoop) 총관리자 2018.03.16 93
10 hadoop 클러스터 실행 스크립트 정리 총관리자 2018.03.20 608
9 resouce manager에 dr.who가 아닌 다른 사용자로 로그인 하기 총관리자 2018.06.28 1207
8 physical memory used되면서 mapper가 kill되는 경우 오류 발생시 조치 총관리자 2018.09.20 1522
쓰기 태그

A personal place to organize information learned during the development of such Hadoop, Hive, Hbase, Semantic IoT, etc.
We are open to the required minutes. Please send inquiries to gooper@gooper.com.

위로